Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sfta2E9PXB6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfta2E9PXB6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfta2E9PXB6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfta2E9PXB6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sfta2E9PXB6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfta2E9PXB6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfta2E9PXB6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfta2E9PXB6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfta2E9PXB6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfta2E9PXB6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfta2E9PXB6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfta2E9PXB6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfta2E9PXB6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfta2E9PXB6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfta2E9PXB6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfta2E9PXB6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfta2E9PXB6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfta2E9PXB6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sfta2E9PXB6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfta2E9PXB6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfta2E9PXB6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfta2E9PXB6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfta2E9PXB6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfta2E9PXB6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfta2E9PXB6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfta2E9PXB6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfta2E9PXB6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfta2E9PXB6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfta2E9PXB6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfta2E9PXB6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sfta2E9PXB6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sfta2E9PXB6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sfta2E9PXB6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfta2E9PXB6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfta2E9PXB6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfta2E9PXB6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfta2E9PXB6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfta2E9PXB6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfta2E9PXB6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sfta2E9PXB6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfta2E9PXB6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfta2E9PXB6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfta2E9PXB6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfta2E9PXB6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfta2E9PXB6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms