Protein–RNA interactions for Protein: E9PVU2

4931429L15Rik, RIKEN cDNA 4931429L15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931429L15RikE9PVU2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4931429L15RikE9PVU2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
4931429L15RikE9PVU2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4931429L15RikE9PVU2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4931429L15RikE9PVU2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
4931429L15RikE9PVU2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4931429L15RikE9PVU2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4931429L15RikE9PVU2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
4931429L15RikE9PVU2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
4931429L15RikE9PVU2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4931429L15RikE9PVU2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4931429L15RikE9PVU2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4931429L15RikE9PVU2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4931429L15RikE9PVU2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4931429L15RikE9PVU2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4931429L15RikE9PVU2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4931429L15RikE9PVU2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4931429L15RikE9PVU2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4931429L15RikE9PVU2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4931429L15RikE9PVU2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4931429L15RikE9PVU2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4931429L15RikE9PVU2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4931429L15RikE9PVU2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
4931429L15RikE9PVU2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
4931429L15RikE9PVU2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4931429L15RikE9PVU2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4931429L15RikE9PVU2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4931429L15RikE9PVU2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4931429L15RikE9PVU2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4931429L15RikE9PVU2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
4931429L15RikE9PVU2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
4931429L15RikE9PVU2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4931429L15RikE9PVU2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4931429L15RikE9PVU2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4931429L15RikE9PVU2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4931429L15RikE9PVU2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4931429L15RikE9PVU2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4931429L15RikE9PVU2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4931429L15RikE9PVU2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4931429L15RikE9PVU2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4931429L15RikE9PVU2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4931429L15RikE9PVU2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4931429L15RikE9PVU2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4931429L15RikE9PVU2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4931429L15RikE9PVU2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4931429L15RikE9PVU2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4931429L15RikE9PVU2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4931429L15RikE9PVU2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4931429L15RikE9PVU2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4931429L15RikE9PVU2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4931429L15RikE9PVU2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
4931429L15RikE9PVU2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4931429L15RikE9PVU2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4931429L15RikE9PVU2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4931429L15RikE9PVU2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4931429L15RikE9PVU2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4931429L15RikE9PVU2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4931429L15RikE9PVU2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4931429L15RikE9PVU2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
4931429L15RikE9PVU2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4931429L15RikE9PVU2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4931429L15RikE9PVU2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4931429L15RikE9PVU2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4931429L15RikE9PVU2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931429L15RikE9PVU2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931429L15RikE9PVU2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4931429L15RikE9PVU2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4931429L15RikE9PVU2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4931429L15RikE9PVU2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4931429L15RikE9PVU2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4931429L15RikE9PVU2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4931429L15RikE9PVU2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4931429L15RikE9PVU2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4931429L15RikE9PVU2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4931429L15RikE9PVU2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4931429L15RikE9PVU2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4931429L15RikE9PVU2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4931429L15RikE9PVU2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4931429L15RikE9PVU2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4931429L15RikE9PVU2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4931429L15RikE9PVU2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4931429L15RikE9PVU2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4931429L15RikE9PVU2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4931429L15RikE9PVU2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4931429L15RikE9PVU2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4931429L15RikE9PVU2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4931429L15RikE9PVU2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4931429L15RikE9PVU2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4931429L15RikE9PVU2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4931429L15RikE9PVU2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4931429L15RikE9PVU2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
4931429L15RikE9PVU2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
4931429L15RikE9PVU2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4931429L15RikE9PVU2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4931429L15RikE9PVU2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4931429L15RikE9PVU2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4931429L15RikE9PVU2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4931429L15RikE9PVU2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4931429L15RikE9PVU2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms