Protein–RNA interactions for Protein: E9PUW8

Ccdc24, Coiled-coil domain-containing 24, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc24E9PUW8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc24E9PUW8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc24E9PUW8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc24E9PUW8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc24E9PUW8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc24E9PUW8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc24E9PUW8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc24E9PUW8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc24E9PUW8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc24E9PUW8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc24E9PUW8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc24E9PUW8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc24E9PUW8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc24E9PUW8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc24E9PUW8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc24E9PUW8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc24E9PUW8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc24E9PUW8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc24E9PUW8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc24E9PUW8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc24E9PUW8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc24E9PUW8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc24E9PUW8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc24E9PUW8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc24E9PUW8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc24E9PUW8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc24E9PUW8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc24E9PUW8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc24E9PUW8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc24E9PUW8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc24E9PUW8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc24E9PUW8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc24E9PUW8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc24E9PUW8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc24E9PUW8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc24E9PUW8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc24E9PUW8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ccdc24E9PUW8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc24E9PUW8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc24E9PUW8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc24E9PUW8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc24E9PUW8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc24E9PUW8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc24E9PUW8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc24E9PUW8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc24E9PUW8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc24E9PUW8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc24E9PUW8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc24E9PUW8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc24E9PUW8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc24E9PUW8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc24E9PUW8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc24E9PUW8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc24E9PUW8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc24E9PUW8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc24E9PUW8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc24E9PUW8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc24E9PUW8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc24E9PUW8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc24E9PUW8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc24E9PUW8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc24E9PUW8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc24E9PUW8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc24E9PUW8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc24E9PUW8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc24E9PUW8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc24E9PUW8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc24E9PUW8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc24E9PUW8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc24E9PUW8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc24E9PUW8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc24E9PUW8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc24E9PUW8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc24E9PUW8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc24E9PUW8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc24E9PUW8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc24E9PUW8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc24E9PUW8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc24E9PUW8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc24E9PUW8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc24E9PUW8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc24E9PUW8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc24E9PUW8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc24E9PUW8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc24E9PUW8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc24E9PUW8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc24E9PUW8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc24E9PUW8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc24E9PUW8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc24E9PUW8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc24E9PUW8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc24E9PUW8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc24E9PUW8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc24E9PUW8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc24E9PUW8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc24E9PUW8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc24E9PUW8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc24E9PUW8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc24E9PUW8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc24E9PUW8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.1 ms