Protein–RNA interactions for Protein: D3Z460

Gm1330, Predicted gene 1330, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1330D3Z460 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1330D3Z460 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm1330D3Z460 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm1330D3Z460 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm1330D3Z460 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm1330D3Z460 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm1330D3Z460 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm1330D3Z460 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm1330D3Z460 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm1330D3Z460 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm1330D3Z460 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm1330D3Z460 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm1330D3Z460 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm1330D3Z460 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm1330D3Z460 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm1330D3Z460 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm1330D3Z460 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm1330D3Z460 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm1330D3Z460 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm1330D3Z460 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm1330D3Z460 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm1330D3Z460 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm1330D3Z460 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm1330D3Z460 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm1330D3Z460 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm1330D3Z460 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm1330D3Z460 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm1330D3Z460 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm1330D3Z460 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm1330D3Z460 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm1330D3Z460 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm1330D3Z460 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm1330D3Z460 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm1330D3Z460 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm1330D3Z460 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm1330D3Z460 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm1330D3Z460 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm1330D3Z460 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm1330D3Z460 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm1330D3Z460 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm1330D3Z460 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm1330D3Z460 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm1330D3Z460 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm1330D3Z460 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm1330D3Z460 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm1330D3Z460 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm1330D3Z460 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm1330D3Z460 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm1330D3Z460 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm1330D3Z460 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm1330D3Z460 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm1330D3Z460 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm1330D3Z460 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm1330D3Z460 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm1330D3Z460 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm1330D3Z460 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm1330D3Z460 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm1330D3Z460 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm1330D3Z460 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm1330D3Z460 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm1330D3Z460 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm1330D3Z460 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm1330D3Z460 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm1330D3Z460 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm1330D3Z460 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm1330D3Z460 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm1330D3Z460 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm1330D3Z460 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm1330D3Z460 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm1330D3Z460 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm1330D3Z460 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm1330D3Z460 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm1330D3Z460 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm1330D3Z460 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm1330D3Z460 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm1330D3Z460 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm1330D3Z460 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm1330D3Z460 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm1330D3Z460 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm1330D3Z460 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1330D3Z460 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1330D3Z460 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1330D3Z460 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1330D3Z460 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm1330D3Z460 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm1330D3Z460 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm1330D3Z460 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm1330D3Z460 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm1330D3Z460 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm1330D3Z460 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm1330D3Z460 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm1330D3Z460 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm1330D3Z460 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm1330D3Z460 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm1330D3Z460 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm1330D3Z460 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm1330D3Z460 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm1330D3Z460 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm1330D3Z460 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm1330D3Z460 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms