Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
9630041A04RikD3Z3U4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
9630041A04RikD3Z3U4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
9630041A04RikD3Z3U4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
9630041A04RikD3Z3U4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
9630041A04RikD3Z3U4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
9630041A04RikD3Z3U4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
9630041A04RikD3Z3U4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
9630041A04RikD3Z3U4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
9630041A04RikD3Z3U4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
9630041A04RikD3Z3U4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
9630041A04RikD3Z3U4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
9630041A04RikD3Z3U4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
9630041A04RikD3Z3U4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
9630041A04RikD3Z3U4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
9630041A04RikD3Z3U4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
9630041A04RikD3Z3U4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
9630041A04RikD3Z3U4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
9630041A04RikD3Z3U4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
9630041A04RikD3Z3U4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
9630041A04RikD3Z3U4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
9630041A04RikD3Z3U4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
9630041A04RikD3Z3U4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
9630041A04RikD3Z3U4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
9630041A04RikD3Z3U4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
9630041A04RikD3Z3U4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
9630041A04RikD3Z3U4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
9630041A04RikD3Z3U4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
9630041A04RikD3Z3U4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
9630041A04RikD3Z3U4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
9630041A04RikD3Z3U4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
9630041A04RikD3Z3U4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
9630041A04RikD3Z3U4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
9630041A04RikD3Z3U4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
9630041A04RikD3Z3U4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
9630041A04RikD3Z3U4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
9630041A04RikD3Z3U4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
9630041A04RikD3Z3U4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
9630041A04RikD3Z3U4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
9630041A04RikD3Z3U4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
9630041A04RikD3Z3U4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
9630041A04RikD3Z3U4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
9630041A04RikD3Z3U4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
9630041A04RikD3Z3U4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
9630041A04RikD3Z3U4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
9630041A04RikD3Z3U4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
9630041A04RikD3Z3U4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
9630041A04RikD3Z3U4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
9630041A04RikD3Z3U4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
9630041A04RikD3Z3U4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
9630041A04RikD3Z3U4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
9630041A04RikD3Z3U4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
9630041A04RikD3Z3U4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
9630041A04RikD3Z3U4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
9630041A04RikD3Z3U4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
9630041A04RikD3Z3U4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
9630041A04RikD3Z3U4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
9630041A04RikD3Z3U4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
9630041A04RikD3Z3U4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
9630041A04RikD3Z3U4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
9630041A04RikD3Z3U4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
9630041A04RikD3Z3U4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
9630041A04RikD3Z3U4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
9630041A04RikD3Z3U4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
9630041A04RikD3Z3U4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
9630041A04RikD3Z3U4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
9630041A04RikD3Z3U4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
9630041A04RikD3Z3U4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
9630041A04RikD3Z3U4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
9630041A04RikD3Z3U4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
9630041A04RikD3Z3U4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
9630041A04RikD3Z3U4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
9630041A04RikD3Z3U4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
9630041A04RikD3Z3U4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
9630041A04RikD3Z3U4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
9630041A04RikD3Z3U4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
9630041A04RikD3Z3U4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
9630041A04RikD3Z3U4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
9630041A04RikD3Z3U4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
9630041A04RikD3Z3U4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
9630041A04RikD3Z3U4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
9630041A04RikD3Z3U4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
9630041A04RikD3Z3U4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
9630041A04RikD3Z3U4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
9630041A04RikD3Z3U4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
9630041A04RikD3Z3U4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
9630041A04RikD3Z3U4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
9630041A04RikD3Z3U4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
9630041A04RikD3Z3U4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
9630041A04RikD3Z3U4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
9630041A04RikD3Z3U4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
9630041A04RikD3Z3U4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
9630041A04RikD3Z3U4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
9630041A04RikD3Z3U4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
9630041A04RikD3Z3U4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
9630041A04RikD3Z3U4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
9630041A04RikD3Z3U4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
9630041A04RikD3Z3U4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
9630041A04RikD3Z3U4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms