Protein–RNA interactions for Protein: D3YUU6

Crnn, Cornulin, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrnnD3YUU6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CrnnD3YUU6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CrnnD3YUU6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CrnnD3YUU6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CrnnD3YUU6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CrnnD3YUU6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CrnnD3YUU6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrnnD3YUU6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CrnnD3YUU6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CrnnD3YUU6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrnnD3YUU6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrnnD3YUU6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrnnD3YUU6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrnnD3YUU6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrnnD3YUU6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrnnD3YUU6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrnnD3YUU6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CrnnD3YUU6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CrnnD3YUU6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CrnnD3YUU6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CrnnD3YUU6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CrnnD3YUU6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CrnnD3YUU6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CrnnD3YUU6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CrnnD3YUU6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CrnnD3YUU6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CrnnD3YUU6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CrnnD3YUU6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CrnnD3YUU6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CrnnD3YUU6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CrnnD3YUU6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CrnnD3YUU6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CrnnD3YUU6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CrnnD3YUU6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CrnnD3YUU6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CrnnD3YUU6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CrnnD3YUU6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CrnnD3YUU6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CrnnD3YUU6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CrnnD3YUU6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CrnnD3YUU6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CrnnD3YUU6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CrnnD3YUU6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CrnnD3YUU6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CrnnD3YUU6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CrnnD3YUU6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CrnnD3YUU6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CrnnD3YUU6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CrnnD3YUU6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CrnnD3YUU6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CrnnD3YUU6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CrnnD3YUU6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CrnnD3YUU6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CrnnD3YUU6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CrnnD3YUU6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CrnnD3YUU6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CrnnD3YUU6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CrnnD3YUU6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CrnnD3YUU6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CrnnD3YUU6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CrnnD3YUU6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CrnnD3YUU6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CrnnD3YUU6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CrnnD3YUU6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CrnnD3YUU6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CrnnD3YUU6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CrnnD3YUU6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CrnnD3YUU6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CrnnD3YUU6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CrnnD3YUU6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CrnnD3YUU6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CrnnD3YUU6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CrnnD3YUU6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CrnnD3YUU6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CrnnD3YUU6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CrnnD3YUU6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CrnnD3YUU6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CrnnD3YUU6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CrnnD3YUU6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CrnnD3YUU6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CrnnD3YUU6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CrnnD3YUU6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CrnnD3YUU6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CrnnD3YUU6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CrnnD3YUU6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CrnnD3YUU6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CrnnD3YUU6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CrnnD3YUU6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CrnnD3YUU6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CrnnD3YUU6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CrnnD3YUU6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CrnnD3YUU6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CrnnD3YUU6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CrnnD3YUU6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CrnnD3YUU6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CrnnD3YUU6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CrnnD3YUU6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CrnnD3YUU6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CrnnD3YUU6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CrnnD3YUU6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms