Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930444P10RikD3YUR1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930444P10RikD3YUR1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930444P10RikD3YUR1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
4930444P10RikD3YUR1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930444P10RikD3YUR1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930444P10RikD3YUR1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930444P10RikD3YUR1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930444P10RikD3YUR1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930444P10RikD3YUR1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930444P10RikD3YUR1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930444P10RikD3YUR1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930444P10RikD3YUR1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930444P10RikD3YUR1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930444P10RikD3YUR1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930444P10RikD3YUR1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930444P10RikD3YUR1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930444P10RikD3YUR1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930444P10RikD3YUR1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930444P10RikD3YUR1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930444P10RikD3YUR1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930444P10RikD3YUR1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930444P10RikD3YUR1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
4930444P10RikD3YUR1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930444P10RikD3YUR1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930444P10RikD3YUR1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
4930444P10RikD3YUR1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930444P10RikD3YUR1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930444P10RikD3YUR1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930444P10RikD3YUR1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930444P10RikD3YUR1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930444P10RikD3YUR1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930444P10RikD3YUR1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930444P10RikD3YUR1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930444P10RikD3YUR1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930444P10RikD3YUR1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930444P10RikD3YUR1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930444P10RikD3YUR1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930444P10RikD3YUR1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930444P10RikD3YUR1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930444P10RikD3YUR1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930444P10RikD3YUR1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930444P10RikD3YUR1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
4930444P10RikD3YUR1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930444P10RikD3YUR1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930444P10RikD3YUR1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930444P10RikD3YUR1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930444P10RikD3YUR1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930444P10RikD3YUR1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930444P10RikD3YUR1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930444P10RikD3YUR1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930444P10RikD3YUR1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930444P10RikD3YUR1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930444P10RikD3YUR1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930444P10RikD3YUR1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930444P10RikD3YUR1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930444P10RikD3YUR1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930444P10RikD3YUR1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930444P10RikD3YUR1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930444P10RikD3YUR1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930444P10RikD3YUR1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930444P10RikD3YUR1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930444P10RikD3YUR1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
4930444P10RikD3YUR1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930444P10RikD3YUR1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930444P10RikD3YUR1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930444P10RikD3YUR1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930444P10RikD3YUR1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930444P10RikD3YUR1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930444P10RikD3YUR1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930444P10RikD3YUR1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930444P10RikD3YUR1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930444P10RikD3YUR1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930444P10RikD3YUR1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930444P10RikD3YUR1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930444P10RikD3YUR1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930444P10RikD3YUR1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930444P10RikD3YUR1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930444P10RikD3YUR1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930444P10RikD3YUR1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930444P10RikD3YUR1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930444P10RikD3YUR1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930444P10RikD3YUR1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930444P10RikD3YUR1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930444P10RikD3YUR1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930444P10RikD3YUR1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930444P10RikD3YUR1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930444P10RikD3YUR1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930444P10RikD3YUR1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930444P10RikD3YUR1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930444P10RikD3YUR1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930444P10RikD3YUR1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930444P10RikD3YUR1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930444P10RikD3YUR1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930444P10RikD3YUR1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930444P10RikD3YUR1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930444P10RikD3YUR1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930444P10RikD3YUR1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930444P10RikD3YUR1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930444P10RikD3YUR1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms