Protein–RNA interactions for Protein: C8YR32

Loxhd1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxhd1C8YR32 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Loxhd1C8YR32 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Loxhd1C8YR32 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Loxhd1C8YR32 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Loxhd1C8YR32 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Loxhd1C8YR32 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Loxhd1C8YR32 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Loxhd1C8YR32 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Loxhd1C8YR32 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Loxhd1C8YR32 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Loxhd1C8YR32 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Loxhd1C8YR32 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Loxhd1C8YR32 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Loxhd1C8YR32 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Loxhd1C8YR32 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Loxhd1C8YR32 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Loxhd1C8YR32 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Loxhd1C8YR32 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Loxhd1C8YR32 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Loxhd1C8YR32 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Loxhd1C8YR32 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Loxhd1C8YR32 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Loxhd1C8YR32 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Loxhd1C8YR32 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Loxhd1C8YR32 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Loxhd1C8YR32 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Loxhd1C8YR32 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Loxhd1C8YR32 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Loxhd1C8YR32 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Loxhd1C8YR32 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Loxhd1C8YR32 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Loxhd1C8YR32 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Loxhd1C8YR32 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Loxhd1C8YR32 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Loxhd1C8YR32 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Loxhd1C8YR32 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Loxhd1C8YR32 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Loxhd1C8YR32 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Loxhd1C8YR32 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Loxhd1C8YR32 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Loxhd1C8YR32 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Loxhd1C8YR32 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Loxhd1C8YR32 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Loxhd1C8YR32 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Loxhd1C8YR32 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Loxhd1C8YR32 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Loxhd1C8YR32 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Loxhd1C8YR32 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Loxhd1C8YR32 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Loxhd1C8YR32 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Loxhd1C8YR32 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Loxhd1C8YR32 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Loxhd1C8YR32 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Loxhd1C8YR32 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Loxhd1C8YR32 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Loxhd1C8YR32 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Loxhd1C8YR32 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Loxhd1C8YR32 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Loxhd1C8YR32 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Loxhd1C8YR32 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Loxhd1C8YR32 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Loxhd1C8YR32 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Loxhd1C8YR32 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Loxhd1C8YR32 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Loxhd1C8YR32 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Loxhd1C8YR32 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Loxhd1C8YR32 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Loxhd1C8YR32 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Loxhd1C8YR32 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Loxhd1C8YR32 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Loxhd1C8YR32 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Loxhd1C8YR32 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Loxhd1C8YR32 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Loxhd1C8YR32 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Loxhd1C8YR32 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Loxhd1C8YR32 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Loxhd1C8YR32 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Loxhd1C8YR32 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Loxhd1C8YR32 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Loxhd1C8YR32 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Loxhd1C8YR32 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Loxhd1C8YR32 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Loxhd1C8YR32 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Loxhd1C8YR32 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Loxhd1C8YR32 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Loxhd1C8YR32 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Loxhd1C8YR32 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Loxhd1C8YR32 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Loxhd1C8YR32 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Loxhd1C8YR32 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Loxhd1C8YR32 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Loxhd1C8YR32 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Loxhd1C8YR32 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Loxhd1C8YR32 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Loxhd1C8YR32 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Loxhd1C8YR32 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Loxhd1C8YR32 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Loxhd1C8YR32 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Loxhd1C8YR32 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Loxhd1C8YR32 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms