Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ankrd34aB2RW11 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ankrd34aB2RW11 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ankrd34aB2RW11 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ankrd34aB2RW11 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ankrd34aB2RW11 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ankrd34aB2RW11 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ankrd34aB2RW11 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ankrd34aB2RW11 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ankrd34aB2RW11 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ankrd34aB2RW11 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ankrd34aB2RW11 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ankrd34aB2RW11 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ankrd34aB2RW11 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ankrd34aB2RW11 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ankrd34aB2RW11 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ankrd34aB2RW11 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ankrd34aB2RW11 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ankrd34aB2RW11 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ankrd34aB2RW11 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ankrd34aB2RW11 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ankrd34aB2RW11 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ankrd34aB2RW11 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ankrd34aB2RW11 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ankrd34aB2RW11 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ankrd34aB2RW11 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ankrd34aB2RW11 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ankrd34aB2RW11 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ankrd34aB2RW11 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ankrd34aB2RW11 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ankrd34aB2RW11 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ankrd34aB2RW11 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ankrd34aB2RW11 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ankrd34aB2RW11 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ankrd34aB2RW11 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ankrd34aB2RW11 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ankrd34aB2RW11 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ankrd34aB2RW11 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ankrd34aB2RW11 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ankrd34aB2RW11 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ankrd34aB2RW11 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ankrd34aB2RW11 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ankrd34aB2RW11 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ankrd34aB2RW11 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ankrd34aB2RW11 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ankrd34aB2RW11 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ankrd34aB2RW11 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ankrd34aB2RW11 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ankrd34aB2RW11 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ankrd34aB2RW11 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ankrd34aB2RW11 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ankrd34aB2RW11 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ankrd34aB2RW11 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ankrd34aB2RW11 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ankrd34aB2RW11 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ankrd34aB2RW11 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ankrd34aB2RW11 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ankrd34aB2RW11 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ankrd34aB2RW11 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ankrd34aB2RW11 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ankrd34aB2RW11 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ankrd34aB2RW11 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ankrd34aB2RW11 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ankrd34aB2RW11 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ankrd34aB2RW11 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ankrd34aB2RW11 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ankrd34aB2RW11 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ankrd34aB2RW11 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ankrd34aB2RW11 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ankrd34aB2RW11 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ankrd34aB2RW11 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ankrd34aB2RW11 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ankrd34aB2RW11 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ankrd34aB2RW11 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ankrd34aB2RW11 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ankrd34aB2RW11 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ankrd34aB2RW11 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ankrd34aB2RW11 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ankrd34aB2RW11 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ankrd34aB2RW11 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ankrd34aB2RW11 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ankrd34aB2RW11 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ankrd34aB2RW11 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ankrd34aB2RW11 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ankrd34aB2RW11 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ankrd34aB2RW11 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ankrd34aB2RW11 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ankrd34aB2RW11 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ankrd34aB2RW11 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ankrd34aB2RW11 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ankrd34aB2RW11 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ankrd34aB2RW11 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ankrd34aB2RW11 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ankrd34aB2RW11 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ankrd34aB2RW11 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ankrd34aB2RW11 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ankrd34aB2RW11 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ankrd34aB2RW11 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ankrd34aB2RW11 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ankrd34aB2RW11 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms