Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Otud7bB2RUR8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Otud7bB2RUR8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Otud7bB2RUR8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Otud7bB2RUR8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Otud7bB2RUR8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Otud7bB2RUR8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Otud7bB2RUR8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Otud7bB2RUR8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Otud7bB2RUR8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Otud7bB2RUR8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Otud7bB2RUR8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Otud7bB2RUR8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Otud7bB2RUR8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Otud7bB2RUR8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Otud7bB2RUR8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Otud7bB2RUR8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Otud7bB2RUR8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Otud7bB2RUR8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Otud7bB2RUR8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Otud7bB2RUR8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Otud7bB2RUR8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Otud7bB2RUR8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Otud7bB2RUR8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Otud7bB2RUR8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Otud7bB2RUR8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Otud7bB2RUR8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Otud7bB2RUR8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Otud7bB2RUR8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Otud7bB2RUR8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Otud7bB2RUR8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Otud7bB2RUR8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Otud7bB2RUR8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Otud7bB2RUR8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Otud7bB2RUR8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Otud7bB2RUR8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Otud7bB2RUR8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Otud7bB2RUR8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Otud7bB2RUR8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Otud7bB2RUR8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Otud7bB2RUR8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Otud7bB2RUR8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Otud7bB2RUR8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Otud7bB2RUR8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Otud7bB2RUR8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Otud7bB2RUR8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Otud7bB2RUR8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Otud7bB2RUR8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Otud7bB2RUR8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Otud7bB2RUR8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Otud7bB2RUR8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Otud7bB2RUR8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Otud7bB2RUR8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Otud7bB2RUR8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Otud7bB2RUR8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Otud7bB2RUR8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Otud7bB2RUR8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Otud7bB2RUR8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Otud7bB2RUR8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Otud7bB2RUR8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Otud7bB2RUR8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Otud7bB2RUR8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Otud7bB2RUR8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Otud7bB2RUR8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Otud7bB2RUR8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Otud7bB2RUR8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Otud7bB2RUR8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Otud7bB2RUR8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Otud7bB2RUR8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Otud7bB2RUR8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Otud7bB2RUR8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Otud7bB2RUR8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Otud7bB2RUR8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Otud7bB2RUR8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Otud7bB2RUR8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Otud7bB2RUR8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Otud7bB2RUR8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Otud7bB2RUR8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Otud7bB2RUR8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Otud7bB2RUR8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Otud7bB2RUR8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Otud7bB2RUR8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Otud7bB2RUR8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Otud7bB2RUR8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Otud7bB2RUR8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Otud7bB2RUR8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Otud7bB2RUR8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Otud7bB2RUR8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Otud7bB2RUR8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Otud7bB2RUR8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Otud7bB2RUR8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Otud7bB2RUR8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Otud7bB2RUR8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Otud7bB2RUR8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Otud7bB2RUR8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Otud7bB2RUR8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Otud7bB2RUR8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Otud7bB2RUR8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Otud7bB2RUR8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Otud7bB2RUR8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms