Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trabd2bB1ATG9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trabd2bB1ATG9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trabd2bB1ATG9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trabd2bB1ATG9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trabd2bB1ATG9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trabd2bB1ATG9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trabd2bB1ATG9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trabd2bB1ATG9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trabd2bB1ATG9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trabd2bB1ATG9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trabd2bB1ATG9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trabd2bB1ATG9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trabd2bB1ATG9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trabd2bB1ATG9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trabd2bB1ATG9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trabd2bB1ATG9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trabd2bB1ATG9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trabd2bB1ATG9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trabd2bB1ATG9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trabd2bB1ATG9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trabd2bB1ATG9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trabd2bB1ATG9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trabd2bB1ATG9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trabd2bB1ATG9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trabd2bB1ATG9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trabd2bB1ATG9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trabd2bB1ATG9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trabd2bB1ATG9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trabd2bB1ATG9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trabd2bB1ATG9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trabd2bB1ATG9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trabd2bB1ATG9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trabd2bB1ATG9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trabd2bB1ATG9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trabd2bB1ATG9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trabd2bB1ATG9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trabd2bB1ATG9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trabd2bB1ATG9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trabd2bB1ATG9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trabd2bB1ATG9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trabd2bB1ATG9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trabd2bB1ATG9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trabd2bB1ATG9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trabd2bB1ATG9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trabd2bB1ATG9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trabd2bB1ATG9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trabd2bB1ATG9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trabd2bB1ATG9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trabd2bB1ATG9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trabd2bB1ATG9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trabd2bB1ATG9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trabd2bB1ATG9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trabd2bB1ATG9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trabd2bB1ATG9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trabd2bB1ATG9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trabd2bB1ATG9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trabd2bB1ATG9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trabd2bB1ATG9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trabd2bB1ATG9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trabd2bB1ATG9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trabd2bB1ATG9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trabd2bB1ATG9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Trabd2bB1ATG9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trabd2bB1ATG9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trabd2bB1ATG9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trabd2bB1ATG9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trabd2bB1ATG9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trabd2bB1ATG9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trabd2bB1ATG9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trabd2bB1ATG9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trabd2bB1ATG9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trabd2bB1ATG9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trabd2bB1ATG9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trabd2bB1ATG9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trabd2bB1ATG9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trabd2bB1ATG9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trabd2bB1ATG9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trabd2bB1ATG9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trabd2bB1ATG9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trabd2bB1ATG9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trabd2bB1ATG9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trabd2bB1ATG9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trabd2bB1ATG9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trabd2bB1ATG9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Trabd2bB1ATG9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trabd2bB1ATG9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trabd2bB1ATG9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trabd2bB1ATG9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trabd2bB1ATG9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trabd2bB1ATG9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trabd2bB1ATG9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trabd2bB1ATG9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trabd2bB1ATG9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trabd2bB1ATG9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trabd2bB1ATG9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trabd2bB1ATG9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trabd2bB1ATG9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
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