Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grik3B1AS29 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grik3B1AS29 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Grik3B1AS29 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Grik3B1AS29 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Grik3B1AS29 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grik3B1AS29 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grik3B1AS29 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grik3B1AS29 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Grik3B1AS29 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grik3B1AS29 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grik3B1AS29 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Grik3B1AS29 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Grik3B1AS29 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grik3B1AS29 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grik3B1AS29 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grik3B1AS29 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Grik3B1AS29 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Grik3B1AS29 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Grik3B1AS29 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Grik3B1AS29 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Grik3B1AS29 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Grik3B1AS29 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Grik3B1AS29 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Grik3B1AS29 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Grik3B1AS29 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grik3B1AS29 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grik3B1AS29 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Grik3B1AS29 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Grik3B1AS29 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Grik3B1AS29 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Grik3B1AS29 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Grik3B1AS29 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Grik3B1AS29 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Grik3B1AS29 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grik3B1AS29 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Grik3B1AS29 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Grik3B1AS29 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Grik3B1AS29 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Grik3B1AS29 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Grik3B1AS29 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Grik3B1AS29 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Grik3B1AS29 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Grik3B1AS29 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Grik3B1AS29 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Grik3B1AS29 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Grik3B1AS29 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grik3B1AS29 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grik3B1AS29 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Grik3B1AS29 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grik3B1AS29 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Grik3B1AS29 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Grik3B1AS29 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Grik3B1AS29 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Grik3B1AS29 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Grik3B1AS29 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Grik3B1AS29 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Grik3B1AS29 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Grik3B1AS29 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Grik3B1AS29 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Grik3B1AS29 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Grik3B1AS29 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Grik3B1AS29 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Grik3B1AS29 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Grik3B1AS29 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Grik3B1AS29 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Grik3B1AS29 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Grik3B1AS29 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Grik3B1AS29 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Grik3B1AS29 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Grik3B1AS29 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Grik3B1AS29 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Grik3B1AS29 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Grik3B1AS29 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Grik3B1AS29 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Grik3B1AS29 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Grik3B1AS29 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Grik3B1AS29 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Grik3B1AS29 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Grik3B1AS29 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Grik3B1AS29 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Grik3B1AS29 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Grik3B1AS29 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Grik3B1AS29 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Grik3B1AS29 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Grik3B1AS29 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Grik3B1AS29 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Grik3B1AS29 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Grik3B1AS29 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Grik3B1AS29 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grik3B1AS29 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Grik3B1AS29 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Grik3B1AS29 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Grik3B1AS29 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Grik3B1AS29 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Grik3B1AS29 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Grik3B1AS29 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Grik3B1AS29 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grik3B1AS29 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Grik3B1AS29 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms