Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Supt3B0QZW4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Supt3B0QZW4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Supt3B0QZW4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Supt3B0QZW4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt3B0QZW4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt3B0QZW4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Supt3B0QZW4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Supt3B0QZW4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Supt3B0QZW4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Supt3B0QZW4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Supt3B0QZW4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Supt3B0QZW4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Supt3B0QZW4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Supt3B0QZW4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Supt3B0QZW4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Supt3B0QZW4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Supt3B0QZW4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Supt3B0QZW4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Supt3B0QZW4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Supt3B0QZW4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Supt3B0QZW4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Supt3B0QZW4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Supt3B0QZW4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Supt3B0QZW4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Supt3B0QZW4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Supt3B0QZW4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Supt3B0QZW4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Supt3B0QZW4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Supt3B0QZW4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Supt3B0QZW4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Supt3B0QZW4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Supt3B0QZW4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Supt3B0QZW4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Supt3B0QZW4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Supt3B0QZW4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Supt3B0QZW4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Supt3B0QZW4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Supt3B0QZW4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Supt3B0QZW4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Supt3B0QZW4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Supt3B0QZW4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Supt3B0QZW4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Supt3B0QZW4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Supt3B0QZW4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Supt3B0QZW4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Supt3B0QZW4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Supt3B0QZW4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Supt3B0QZW4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Supt3B0QZW4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt3B0QZW4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt3B0QZW4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Supt3B0QZW4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Supt3B0QZW4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Supt3B0QZW4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Supt3B0QZW4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Supt3B0QZW4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Supt3B0QZW4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt3B0QZW4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt3B0QZW4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Supt3B0QZW4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Supt3B0QZW4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Supt3B0QZW4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Supt3B0QZW4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Supt3B0QZW4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Supt3B0QZW4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Supt3B0QZW4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Supt3B0QZW4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Supt3B0QZW4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Supt3B0QZW4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Supt3B0QZW4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Supt3B0QZW4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Supt3B0QZW4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Supt3B0QZW4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Supt3B0QZW4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Supt3B0QZW4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Supt3B0QZW4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Supt3B0QZW4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Supt3B0QZW4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt3B0QZW4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt3B0QZW4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Supt3B0QZW4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Supt3B0QZW4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Supt3B0QZW4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Supt3B0QZW4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Supt3B0QZW4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Supt3B0QZW4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt3B0QZW4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Supt3B0QZW4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt3B0QZW4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt3B0QZW4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt3B0QZW4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Supt3B0QZW4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Supt3B0QZW4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Supt3B0QZW4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt3B0QZW4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Supt3B0QZW4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt3B0QZW4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Supt3B0QZW4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Supt3B0QZW4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms