Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skint2A7XUX6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint2A7XUX6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skint2A7XUX6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skint2A7XUX6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint2A7XUX6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint2A7XUX6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint2A7XUX6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint2A7XUX6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skint2A7XUX6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Skint2A7XUX6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skint2A7XUX6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skint2A7XUX6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint2A7XUX6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint2A7XUX6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint2A7XUX6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skint2A7XUX6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skint2A7XUX6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skint2A7XUX6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skint2A7XUX6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skint2A7XUX6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skint2A7XUX6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Skint2A7XUX6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skint2A7XUX6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skint2A7XUX6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skint2A7XUX6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skint2A7XUX6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint2A7XUX6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint2A7XUX6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint2A7XUX6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint2A7XUX6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint2A7XUX6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint2A7XUX6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint2A7XUX6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint2A7XUX6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint2A7XUX6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skint2A7XUX6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Skint2A7XUX6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Skint2A7XUX6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skint2A7XUX6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skint2A7XUX6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skint2A7XUX6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Skint2A7XUX6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skint2A7XUX6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skint2A7XUX6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint2A7XUX6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint2A7XUX6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint2A7XUX6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint2A7XUX6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint2A7XUX6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint2A7XUX6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint2A7XUX6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint2A7XUX6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint2A7XUX6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint2A7XUX6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint2A7XUX6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skint2A7XUX6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skint2A7XUX6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Skint2A7XUX6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skint2A7XUX6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skint2A7XUX6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skint2A7XUX6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skint2A7XUX6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skint2A7XUX6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skint2A7XUX6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skint2A7XUX6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint2A7XUX6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skint2A7XUX6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skint2A7XUX6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skint2A7XUX6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skint2A7XUX6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skint2A7XUX6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skint2A7XUX6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skint2A7XUX6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skint2A7XUX6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skint2A7XUX6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skint2A7XUX6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skint2A7XUX6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skint2A7XUX6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Skint2A7XUX6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint2A7XUX6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint2A7XUX6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skint2A7XUX6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skint2A7XUX6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skint2A7XUX6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint2A7XUX6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint2A7XUX6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skint2A7XUX6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skint2A7XUX6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skint2A7XUX6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Skint2A7XUX6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skint2A7XUX6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint2A7XUX6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint2A7XUX6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint2A7XUX6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint2A7XUX6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint2A7XUX6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skint2A7XUX6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Skint2A7XUX6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Skint2A7XUX6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.7 ms