Protein–RNA interactions for Protein: A6PWV5

Arid3c, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3cA6PWV5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41,75■■■■■ 4,27
Arid3cA6PWV5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,73■■■■■ 4,27
Arid3cA6PWV5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,72■■■■■ 4,27
Arid3cA6PWV5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC41,69■■■■■ 4,26
Arid3cA6PWV5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,68■■■■■ 4,26
Arid3cA6PWV5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC41,68■■■■■ 4,26
Arid3cA6PWV5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,65■■■■■ 4,26
Arid3cA6PWV5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,65■■■■■ 4,26
Arid3cA6PWV5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,63■■■■■ 4,25
Arid3cA6PWV5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,62■■■■■ 4,25
Arid3cA6PWV5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,61■■■■■ 4,25
Arid3cA6PWV5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,61■■■■■ 4,25
Arid3cA6PWV5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC41,59■■■■■ 4,25
Arid3cA6PWV5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,58■■■■■ 4,25
Arid3cA6PWV5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC41,56■■■■■ 4,24
Arid3cA6PWV5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41,54■■■■■ 4,24
Arid3cA6PWV5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC41,52■■■■■ 4,24
Arid3cA6PWV5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,52■■■■■ 4,24
Arid3cA6PWV5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,51■■■■■ 4,24
Arid3cA6PWV5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC41,51■■■■■ 4,24
Arid3cA6PWV5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,49■■■■■ 4,23
Arid3cA6PWV5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC41,47■■■■■ 4,23
Arid3cA6PWV5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,45■■■■■ 4,23
Arid3cA6PWV5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,45■■■■■ 4,23
Arid3cA6PWV5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC41,44■■■■■ 4,22
Arid3cA6PWV5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,43■■■■■ 4,22
Arid3cA6PWV5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC41,41■■■■■ 4,22
Arid3cA6PWV5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC41,41■■■■■ 4,22
Arid3cA6PWV5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41,39■■■■■ 4,22
Arid3cA6PWV5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC41,38■■■■■ 4,21
Arid3cA6PWV5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC41,37■■■■■ 4,21
Arid3cA6PWV5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,37■■■■■ 4,21
Arid3cA6PWV5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,36■■■■■ 4,21
Arid3cA6PWV5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC41,32■■■■■ 4,21
Arid3cA6PWV5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC41,29■■■■■ 4,2
Arid3cA6PWV5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC41,27■■■■■ 4,2
Arid3cA6PWV5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,24■■■■■ 4,19
Arid3cA6PWV5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,24■■■■■ 4,19
Arid3cA6PWV5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC41,24■■■■■ 4,19
Arid3cA6PWV5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,22■■■■■ 4,19
Arid3cA6PWV5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC41,22■■■■■ 4,19
Arid3cA6PWV5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,22■■■■■ 4,19
Arid3cA6PWV5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC41,15■■■■■ 4,18
Arid3cA6PWV5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC41,14■■■■■ 4,18
Arid3cA6PWV5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,14■■■■■ 4,18
Arid3cA6PWV5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,13■■■■■ 4,17
Arid3cA6PWV5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,12■■■■■ 4,17
Arid3cA6PWV5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC41,11■■■■■ 4,17
Arid3cA6PWV5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC41,11■■■■■ 4,17
Arid3cA6PWV5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC41,06■■■■■ 4,16
Arid3cA6PWV5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC41,03■■■■■ 4,16
Arid3cA6PWV5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,01■■■■■ 4,16
Arid3cA6PWV5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC40,94■■■■■ 4,14
Arid3cA6PWV5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,92■■■■■ 4,14
Arid3cA6PWV5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC40,91■■■■■ 4,14
Arid3cA6PWV5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,91■■■■■ 4,14
Arid3cA6PWV5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,89■■■■■ 4,14
Arid3cA6PWV5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC40,88■■■■■ 4,13
Arid3cA6PWV5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC40,88■■■■■ 4,13
Arid3cA6PWV5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC40,87■■■■■ 4,13
Arid3cA6PWV5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC40,82■■■■■ 4,13
Arid3cA6PWV5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC40,81■■■■■ 4,12
Arid3cA6PWV5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC40,8■■■■■ 4,12
Arid3cA6PWV5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
Arid3cA6PWV5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC40,76■■■■■ 4,12
Arid3cA6PWV5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,75■■■■■ 4,11
Arid3cA6PWV5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,72■■■■■ 4,11
Arid3cA6PWV5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC40,69■■■■■ 4,1
Arid3cA6PWV5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,68■■■■■ 4,1
Arid3cA6PWV5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,64■■■■■ 4,1
Arid3cA6PWV5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,6■■■■■ 4,09
Arid3cA6PWV5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC40,57■■■■■ 4,09
Arid3cA6PWV5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC40,56■■■■■ 4,08
Arid3cA6PWV5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,54■■■■■ 4,08
Arid3cA6PWV5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,53■■■■■ 4,08
Arid3cA6PWV5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,5■■■■■ 4,07
Arid3cA6PWV5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,44■■■■■ 4,06
Arid3cA6PWV5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,43■■■■■ 4,06
Arid3cA6PWV5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Arid3cA6PWV5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
Arid3cA6PWV5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,38■■■■■ 4,05
Arid3cA6PWV5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC40,34■■■■■ 4,05
Arid3cA6PWV5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC40,31■■■■■ 4,04
Arid3cA6PWV5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC40,29■■■■■ 4,04
Arid3cA6PWV5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40,25■■■■■ 4,03
Arid3cA6PWV5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC40,24■■■■■ 4,03
Arid3cA6PWV5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,23■■■■■ 4,03
Arid3cA6PWV5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC40,23■■■■■ 4,03
Arid3cA6PWV5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC40,23■■■■■ 4,03
Arid3cA6PWV5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC40,22■■■■■ 4,03
Arid3cA6PWV5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC40,2■■■■■ 4,03
Arid3cA6PWV5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,17■■■■■ 4,02
Arid3cA6PWV5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC40,17■■■■■ 4,02
Arid3cA6PWV5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,17■■■■■ 4,02
Arid3cA6PWV5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC40,14■■■■■ 4,02
Arid3cA6PWV5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,13■■■■■ 4,02
Arid3cA6PWV5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC40,13■■■■■ 4,01
Arid3cA6PWV5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,13■■■■■ 4,01
Arid3cA6PWV5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,11■■■■■ 4,01
Arid3cA6PWV5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC40,08■■■■■ 4,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,6 ms