Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC35,58■■■■□ 3,29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC35,54■■■■□ 3,28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC35,5■■■■□ 3,27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC35,48■■■■□ 3,27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC35,46■■■■□ 3,27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC35,43■■■■□ 3,26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC35,41■■■■□ 3,26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC35,41■■■■□ 3,26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC35,35■■■■□ 3,25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,34■■■■□ 3,25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC35,3■■■■□ 3,24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC35,24■■■■□ 3,23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC35,22■■■■□ 3,23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC35,19■■■■□ 3,22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC35,09■■■■□ 3,21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3,19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34,99■■■■□ 3,19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,97■■■■□ 3,19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC34,93■■■■□ 3,18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC34,83■■■■□ 3,17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,82■■■■□ 3,16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,79■■■■□ 3,16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34,77■■■■□ 3,16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,73■■■■□ 3,15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC34,71■■■■□ 3,15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34,71■■■■□ 3,15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34,71■■■■□ 3,15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC34,65■■■■□ 3,14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34,6■■■■□ 3,13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC34,59■■■■□ 3,13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34,58■■■■□ 3,13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,57■■■■□ 3,13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34,57■■■■□ 3,12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC34,55■■■■□ 3,12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC34,5■■■■□ 3,11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34,49■■■■□ 3,11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms