Protein–RNA interactions for Protein: A2ALU4

Shroom2, Protein Shroom2, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom2A2ALU4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,66■■■■■ 4,74
Shroom2A2ALU4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC44,66■■■■■ 4,74
Shroom2A2ALU4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44,65■■■■■ 4,74
Shroom2A2ALU4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44,59■■■■■ 4,73
Shroom2A2ALU4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC44,59■■■■■ 4,73
Shroom2A2ALU4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC44,55■■■■■ 4,72
Shroom2A2ALU4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC44,53■■■■■ 4,72
Shroom2A2ALU4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,53■■■■■ 4,72
Shroom2A2ALU4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,52■■■■■ 4,72
Shroom2A2ALU4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,5■■■■■ 4,71
Shroom2A2ALU4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC44,48■■■■■ 4,71
Shroom2A2ALU4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC44,48■■■■■ 4,71
Shroom2A2ALU4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44,46■■■■■ 4,71
Shroom2A2ALU4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC44,43■■■■■ 4,7
Shroom2A2ALU4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC44,35■■■■■ 4,69
Shroom2A2ALU4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,34■■■■■ 4,69
Shroom2A2ALU4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC44,33■■■■■ 4,69
Shroom2A2ALU4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC44,32■■■■■ 4,68
Shroom2A2ALU4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC44,27■■■■■ 4,68
Shroom2A2ALU4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC44,26■■■■■ 4,68
Shroom2A2ALU4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC44,2■■■■■ 4,67
Shroom2A2ALU4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC44,17■■■■■ 4,66
Shroom2A2ALU4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,15■■■■■ 4,66
Shroom2A2ALU4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,12■■■■■ 4,65
Shroom2A2ALU4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC44,12■■■■■ 4,65
Shroom2A2ALU4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC44,11■■■■■ 4,65
Shroom2A2ALU4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC44,11■■■■■ 4,65
Shroom2A2ALU4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,08■■■■■ 4,65
Shroom2A2ALU4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC44,08■■■■■ 4,65
Shroom2A2ALU4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,07■■■■■ 4,65
Shroom2A2ALU4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,05■■■■■ 4,64
Shroom2A2ALU4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC44,05■■■■■ 4,64
Shroom2A2ALU4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44,04■■■■■ 4,64
Shroom2A2ALU4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,03■■■■■ 4,64
Shroom2A2ALU4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC43,98■■■■■ 4,63
Shroom2A2ALU4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC43,89■■■■■ 4,62
Shroom2A2ALU4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,85■■■■■ 4,61
Shroom2A2ALU4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC43,83■■■■■ 4,61
Shroom2A2ALU4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC43,83■■■■■ 4,61
Shroom2A2ALU4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC43,82■■■■■ 4,6
Shroom2A2ALU4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC43,81■■■■■ 4,6
Shroom2A2ALU4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC43,81■■■■■ 4,6
Shroom2A2ALU4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,81■■■■■ 4,6
Shroom2A2ALU4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,75■■■■■ 4,59
Shroom2A2ALU4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43,74■■■■■ 4,59
Shroom2A2ALU4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,74■■■■■ 4,59
Shroom2A2ALU4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,71■■■■■ 4,59
Shroom2A2ALU4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC43,69■■■■■ 4,58
Shroom2A2ALU4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC43,68■■■■■ 4,58
Shroom2A2ALU4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,63■■■■■ 4,57
Shroom2A2ALU4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,58■■■■■ 4,57
Shroom2A2ALU4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC43,55■■■■■ 4,56
Shroom2A2ALU4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,54■■■■■ 4,56
Shroom2A2ALU4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC43,54■■■■■ 4,56
Shroom2A2ALU4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC43,52■■■■■ 4,56
Shroom2A2ALU4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC43,52■■■■■ 4,56
Shroom2A2ALU4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC43,51■■■■■ 4,56
Shroom2A2ALU4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43,49■■■■■ 4,55
Shroom2A2ALU4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43,46■■■■■ 4,55
Shroom2A2ALU4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC43,43■■■■■ 4,54
Shroom2A2ALU4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43,41■■■■■ 4,54
Shroom2A2ALU4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,4■■■■■ 4,54
Shroom2A2ALU4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,38■■■■■ 4,54
Shroom2A2ALU4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,37■■■■■ 4,53
Shroom2A2ALU4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,37■■■■■ 4,53
Shroom2A2ALU4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,33■■■■■ 4,53
Shroom2A2ALU4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC43,32■■■■■ 4,52
Shroom2A2ALU4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,27■■■■■ 4,52
Shroom2A2ALU4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC43,25■■■■■ 4,51
Shroom2A2ALU4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC43,23■■■■■ 4,51
Shroom2A2ALU4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC43,21■■■■■ 4,51
Shroom2A2ALU4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC43,2■■■■■ 4,51
Shroom2A2ALU4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC43,13■■■■■ 4,49
Shroom2A2ALU4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC43,01■■■■■ 4,48
Shroom2A2ALU4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,01■■■■■ 4,48
Shroom2A2ALU4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC43,01■■■■■ 4,48
Shroom2A2ALU4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC43■■■■■ 4,47
Shroom2A2ALU4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,97■■■■■ 4,47
Shroom2A2ALU4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC42,96■■■■■ 4,47
Shroom2A2ALU4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42,95■■■■■ 4,47
Shroom2A2ALU4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC42,95■■■■■ 4,47
Shroom2A2ALU4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,95■■■■■ 4,47
Shroom2A2ALU4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,95■■■■■ 4,47
Shroom2A2ALU4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC42,93■■■■■ 4,46
Shroom2A2ALU4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42,87■■■■■ 4,45
Shroom2A2ALU4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,86■■■■■ 4,45
Shroom2A2ALU4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42,84■■■■■ 4,45
Shroom2A2ALU4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC42,84■■■■■ 4,45
Shroom2A2ALU4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,84■■■■■ 4,45
Shroom2A2ALU4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC42,78■■■■■ 4,44
Shroom2A2ALU4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,78■■■■■ 4,44
Shroom2A2ALU4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,77■■■■■ 4,44
Shroom2A2ALU4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,77■■■■■ 4,44
Shroom2A2ALU4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,76■■■■■ 4,44
Shroom2A2ALU4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC42,74■■■■■ 4,43
Shroom2A2ALU4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC42,74■■■■■ 4,43
Shroom2A2ALU4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC42,74■■■■■ 4,43
Shroom2A2ALU4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,73■■■■■ 4,43
Shroom2A2ALU4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42,73■■■■■ 4,43
Shroom2A2ALU4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC42,72■■■■■ 4,43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms