Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
VirmaA2AIV2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
VirmaA2AIV2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
VirmaA2AIV2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
VirmaA2AIV2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
VirmaA2AIV2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
VirmaA2AIV2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
VirmaA2AIV2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
VirmaA2AIV2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
VirmaA2AIV2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
VirmaA2AIV2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
VirmaA2AIV2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
VirmaA2AIV2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
VirmaA2AIV2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
VirmaA2AIV2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
VirmaA2AIV2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
VirmaA2AIV2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
VirmaA2AIV2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
VirmaA2AIV2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
VirmaA2AIV2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
VirmaA2AIV2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
VirmaA2AIV2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
VirmaA2AIV2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
VirmaA2AIV2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
VirmaA2AIV2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
VirmaA2AIV2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
VirmaA2AIV2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
VirmaA2AIV2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
VirmaA2AIV2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
VirmaA2AIV2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
VirmaA2AIV2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
VirmaA2AIV2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
VirmaA2AIV2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
VirmaA2AIV2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
VirmaA2AIV2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
VirmaA2AIV2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
VirmaA2AIV2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
VirmaA2AIV2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
VirmaA2AIV2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
VirmaA2AIV2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
VirmaA2AIV2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
VirmaA2AIV2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
VirmaA2AIV2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
VirmaA2AIV2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
VirmaA2AIV2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
VirmaA2AIV2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
VirmaA2AIV2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
VirmaA2AIV2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
VirmaA2AIV2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
VirmaA2AIV2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
VirmaA2AIV2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
VirmaA2AIV2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
VirmaA2AIV2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
VirmaA2AIV2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
VirmaA2AIV2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
VirmaA2AIV2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
VirmaA2AIV2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
VirmaA2AIV2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
VirmaA2AIV2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
VirmaA2AIV2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
VirmaA2AIV2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
VirmaA2AIV2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
VirmaA2AIV2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
VirmaA2AIV2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
VirmaA2AIV2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
VirmaA2AIV2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
VirmaA2AIV2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
VirmaA2AIV2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
VirmaA2AIV2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
VirmaA2AIV2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
VirmaA2AIV2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
VirmaA2AIV2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
VirmaA2AIV2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
VirmaA2AIV2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
VirmaA2AIV2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
VirmaA2AIV2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
VirmaA2AIV2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
VirmaA2AIV2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
VirmaA2AIV2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
VirmaA2AIV2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
VirmaA2AIV2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
VirmaA2AIV2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
VirmaA2AIV2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
VirmaA2AIV2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
VirmaA2AIV2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
VirmaA2AIV2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
VirmaA2AIV2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
VirmaA2AIV2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
VirmaA2AIV2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
VirmaA2AIV2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
VirmaA2AIV2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
VirmaA2AIV2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
VirmaA2AIV2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
VirmaA2AIV2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
VirmaA2AIV2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
VirmaA2AIV2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
VirmaA2AIV2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
VirmaA2AIV2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
VirmaA2AIV2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
VirmaA2AIV2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms