Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhbdl2A2AGA4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhbdl2A2AGA4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhbdl2A2AGA4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhbdl2A2AGA4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhbdl2A2AGA4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhbdl2A2AGA4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhbdl2A2AGA4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdl2A2AGA4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhbdl2A2AGA4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhbdl2A2AGA4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhbdl2A2AGA4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhbdl2A2AGA4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhbdl2A2AGA4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhbdl2A2AGA4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhbdl2A2AGA4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhbdl2A2AGA4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhbdl2A2AGA4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhbdl2A2AGA4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhbdl2A2AGA4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhbdl2A2AGA4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhbdl2A2AGA4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhbdl2A2AGA4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhbdl2A2AGA4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhbdl2A2AGA4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhbdl2A2AGA4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhbdl2A2AGA4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhbdl2A2AGA4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhbdl2A2AGA4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhbdl2A2AGA4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhbdl2A2AGA4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhbdl2A2AGA4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhbdl2A2AGA4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhbdl2A2AGA4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhbdl2A2AGA4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhbdl2A2AGA4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhbdl2A2AGA4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhbdl2A2AGA4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhbdl2A2AGA4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhbdl2A2AGA4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhbdl2A2AGA4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhbdl2A2AGA4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhbdl2A2AGA4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhbdl2A2AGA4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhbdl2A2AGA4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhbdl2A2AGA4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhbdl2A2AGA4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhbdl2A2AGA4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhbdl2A2AGA4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhbdl2A2AGA4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhbdl2A2AGA4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhbdl2A2AGA4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhbdl2A2AGA4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rhbdl2A2AGA4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rhbdl2A2AGA4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhbdl2A2AGA4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhbdl2A2AGA4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhbdl2A2AGA4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhbdl2A2AGA4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhbdl2A2AGA4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhbdl2A2AGA4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhbdl2A2AGA4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhbdl2A2AGA4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhbdl2A2AGA4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhbdl2A2AGA4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhbdl2A2AGA4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhbdl2A2AGA4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhbdl2A2AGA4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhbdl2A2AGA4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhbdl2A2AGA4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhbdl2A2AGA4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhbdl2A2AGA4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhbdl2A2AGA4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhbdl2A2AGA4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhbdl2A2AGA4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhbdl2A2AGA4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhbdl2A2AGA4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhbdl2A2AGA4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhbdl2A2AGA4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhbdl2A2AGA4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhbdl2A2AGA4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rhbdl2A2AGA4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhbdl2A2AGA4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhbdl2A2AGA4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhbdl2A2AGA4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhbdl2A2AGA4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhbdl2A2AGA4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhbdl2A2AGA4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhbdl2A2AGA4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhbdl2A2AGA4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rhbdl2A2AGA4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rhbdl2A2AGA4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhbdl2A2AGA4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhbdl2A2AGA4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rhbdl2A2AGA4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhbdl2A2AGA4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhbdl2A2AGA4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhbdl2A2AGA4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rhbdl2A2AGA4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rhbdl2A2AGA4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms