Protein–RNA interactions for Protein: A2AAE1

Kiaa1109, Uncharacterized protein KIAA1109, mousemouse

Predictions only

Length 5,005 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1109A2AAE1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kiaa1109A2AAE1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kiaa1109A2AAE1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kiaa1109A2AAE1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Kiaa1109A2AAE1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Kiaa1109A2AAE1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Kiaa1109A2AAE1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kiaa1109A2AAE1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kiaa1109A2AAE1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kiaa1109A2AAE1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kiaa1109A2AAE1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kiaa1109A2AAE1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kiaa1109A2AAE1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kiaa1109A2AAE1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kiaa1109A2AAE1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Kiaa1109A2AAE1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kiaa1109A2AAE1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kiaa1109A2AAE1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Kiaa1109A2AAE1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kiaa1109A2AAE1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kiaa1109A2AAE1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kiaa1109A2AAE1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kiaa1109A2AAE1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kiaa1109A2AAE1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kiaa1109A2AAE1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kiaa1109A2AAE1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kiaa1109A2AAE1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kiaa1109A2AAE1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kiaa1109A2AAE1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kiaa1109A2AAE1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kiaa1109A2AAE1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kiaa1109A2AAE1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kiaa1109A2AAE1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kiaa1109A2AAE1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kiaa1109A2AAE1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kiaa1109A2AAE1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kiaa1109A2AAE1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kiaa1109A2AAE1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kiaa1109A2AAE1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kiaa1109A2AAE1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kiaa1109A2AAE1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kiaa1109A2AAE1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kiaa1109A2AAE1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kiaa1109A2AAE1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kiaa1109A2AAE1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Kiaa1109A2AAE1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kiaa1109A2AAE1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kiaa1109A2AAE1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kiaa1109A2AAE1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kiaa1109A2AAE1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kiaa1109A2AAE1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kiaa1109A2AAE1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kiaa1109A2AAE1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kiaa1109A2AAE1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kiaa1109A2AAE1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kiaa1109A2AAE1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kiaa1109A2AAE1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Kiaa1109A2AAE1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Kiaa1109A2AAE1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kiaa1109A2AAE1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kiaa1109A2AAE1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kiaa1109A2AAE1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kiaa1109A2AAE1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kiaa1109A2AAE1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kiaa1109A2AAE1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kiaa1109A2AAE1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kiaa1109A2AAE1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kiaa1109A2AAE1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kiaa1109A2AAE1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kiaa1109A2AAE1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kiaa1109A2AAE1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kiaa1109A2AAE1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Kiaa1109A2AAE1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Kiaa1109A2AAE1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kiaa1109A2AAE1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kiaa1109A2AAE1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kiaa1109A2AAE1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kiaa1109A2AAE1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kiaa1109A2AAE1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kiaa1109A2AAE1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kiaa1109A2AAE1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kiaa1109A2AAE1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kiaa1109A2AAE1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kiaa1109A2AAE1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kiaa1109A2AAE1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kiaa1109A2AAE1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kiaa1109A2AAE1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kiaa1109A2AAE1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kiaa1109A2AAE1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kiaa1109A2AAE1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kiaa1109A2AAE1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kiaa1109A2AAE1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kiaa1109A2AAE1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kiaa1109A2AAE1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kiaa1109A2AAE1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kiaa1109A2AAE1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kiaa1109A2AAE1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kiaa1109A2AAE1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kiaa1109A2AAE1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kiaa1109A2AAE1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms