Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Itgb4A2A863 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Itgb4A2A863 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Itgb4A2A863 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Itgb4A2A863 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Itgb4A2A863 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Itgb4A2A863 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Itgb4A2A863 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Itgb4A2A863 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Itgb4A2A863 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Itgb4A2A863 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Itgb4A2A863 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Itgb4A2A863 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Itgb4A2A863 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Itgb4A2A863 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Itgb4A2A863 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Itgb4A2A863 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Itgb4A2A863 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Itgb4A2A863 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Itgb4A2A863 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Itgb4A2A863 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Itgb4A2A863 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Itgb4A2A863 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Itgb4A2A863 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Itgb4A2A863 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Itgb4A2A863 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Itgb4A2A863 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Itgb4A2A863 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Itgb4A2A863 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Itgb4A2A863 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Itgb4A2A863 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Itgb4A2A863 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Itgb4A2A863 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Itgb4A2A863 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Itgb4A2A863 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Itgb4A2A863 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Itgb4A2A863 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Itgb4A2A863 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Itgb4A2A863 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Itgb4A2A863 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Itgb4A2A863 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Itgb4A2A863 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Itgb4A2A863 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Itgb4A2A863 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Itgb4A2A863 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Itgb4A2A863 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Itgb4A2A863 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Itgb4A2A863 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Itgb4A2A863 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Itgb4A2A863 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Itgb4A2A863 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Itgb4A2A863 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Itgb4A2A863 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Itgb4A2A863 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Itgb4A2A863 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Itgb4A2A863 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Itgb4A2A863 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Itgb4A2A863 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Itgb4A2A863 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Itgb4A2A863 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Itgb4A2A863 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Itgb4A2A863 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Itgb4A2A863 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Itgb4A2A863 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Itgb4A2A863 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Itgb4A2A863 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Itgb4A2A863 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Itgb4A2A863 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Itgb4A2A863 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Itgb4A2A863 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Itgb4A2A863 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Itgb4A2A863 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Itgb4A2A863 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Itgb4A2A863 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Itgb4A2A863 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Itgb4A2A863 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Itgb4A2A863 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Itgb4A2A863 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Itgb4A2A863 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Itgb4A2A863 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Itgb4A2A863 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Itgb4A2A863 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Itgb4A2A863 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Itgb4A2A863 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Itgb4A2A863 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Itgb4A2A863 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Itgb4A2A863 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Itgb4A2A863 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Itgb4A2A863 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Itgb4A2A863 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Itgb4A2A863 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Itgb4A2A863 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Itgb4A2A863 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Itgb4A2A863 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Itgb4A2A863 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Itgb4A2A863 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Itgb4A2A863 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Itgb4A2A863 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Itgb4A2A863 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Itgb4A2A863 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms