Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Fam71e1A1L3C1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Fam71e1A1L3C1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Fam71e1A1L3C1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Fam71e1A1L3C1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Fam71e1A1L3C1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Fam71e1A1L3C1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Fam71e1A1L3C1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fam71e1A1L3C1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Fam71e1A1L3C1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Fam71e1A1L3C1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Fam71e1A1L3C1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Fam71e1A1L3C1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Fam71e1A1L3C1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Fam71e1A1L3C1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Fam71e1A1L3C1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Fam71e1A1L3C1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Fam71e1A1L3C1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Fam71e1A1L3C1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Fam71e1A1L3C1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Fam71e1A1L3C1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Fam71e1A1L3C1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Fam71e1A1L3C1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fam71e1A1L3C1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Fam71e1A1L3C1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Fam71e1A1L3C1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Fam71e1A1L3C1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Fam71e1A1L3C1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Fam71e1A1L3C1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Fam71e1A1L3C1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Fam71e1A1L3C1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Fam71e1A1L3C1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Fam71e1A1L3C1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Fam71e1A1L3C1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Fam71e1A1L3C1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Fam71e1A1L3C1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Fam71e1A1L3C1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Fam71e1A1L3C1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Fam71e1A1L3C1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Fam71e1A1L3C1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Fam71e1A1L3C1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Fam71e1A1L3C1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Fam71e1A1L3C1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Fam71e1A1L3C1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Fam71e1A1L3C1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Fam71e1A1L3C1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Fam71e1A1L3C1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Fam71e1A1L3C1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Fam71e1A1L3C1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Fam71e1A1L3C1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Fam71e1A1L3C1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Fam71e1A1L3C1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Fam71e1A1L3C1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Fam71e1A1L3C1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Fam71e1A1L3C1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Fam71e1A1L3C1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Fam71e1A1L3C1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fam71e1A1L3C1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fam71e1A1L3C1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fam71e1A1L3C1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fam71e1A1L3C1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fam71e1A1L3C1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Fam71e1A1L3C1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fam71e1A1L3C1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fam71e1A1L3C1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Fam71e1A1L3C1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Fam71e1A1L3C1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Fam71e1A1L3C1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Fam71e1A1L3C1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Fam71e1A1L3C1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Fam71e1A1L3C1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Fam71e1A1L3C1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Fam71e1A1L3C1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Fam71e1A1L3C1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Fam71e1A1L3C1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Fam71e1A1L3C1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Fam71e1A1L3C1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Fam71e1A1L3C1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Fam71e1A1L3C1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Fam71e1A1L3C1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Fam71e1A1L3C1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Fam71e1A1L3C1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fam71e1A1L3C1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fam71e1A1L3C1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Fam71e1A1L3C1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Fam71e1A1L3C1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Fam71e1A1L3C1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Fam71e1A1L3C1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Fam71e1A1L3C1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fam71e1A1L3C1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fam71e1A1L3C1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fam71e1A1L3C1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fam71e1A1L3C1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fam71e1A1L3C1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Fam71e1A1L3C1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fam71e1A1L3C1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Fam71e1A1L3C1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fam71e1A1L3C1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fam71e1A1L3C1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Fam71e1A1L3C1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms