Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Cpsf3-211ENSMUST00000222968 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Ssb-206ENSMUST00000166411 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 BC017643-202ENSMUST00000106115 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fndc8Q9D2H8 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Grik1-211ENSMUST00000228188 3221 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fndc8Q9D2H8 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms