Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Vegfa-204ENSMUST00000113520 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm11493-201ENSMUST00000134567 566 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm14344-201ENSMUST00000139338 580 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm26483-201ENSMUST00000158016 104 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 2410141K09Rik-204ENSMUST00000173583 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 BC002189-201ENSMUST00000195674 598 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Pf4-203ENSMUST00000202625 411 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Cox7a1-202ENSMUST00000208441 485 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm42067-202ENSMUST00000210917 410 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm7664-201ENSMUST00000221988 745 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm22982-201ENSMUST00000082613 319 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Olfr1155-201ENSMUST00000099843 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Ctse-201ENSMUST00000073350 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Tph1-202ENSMUST00000107669 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 2310016D03Rik-201ENSMUST00000190206 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm13413-201ENSMUST00000120953 602 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 A730090N16Rik-201ENSMUST00000160137 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm27383-201ENSMUST00000184418 361 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm42764-201ENSMUST00000197835 741 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Rab38-202ENSMUST00000208478 579 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Tmem89-201ENSMUST00000026744 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Ribc1-201ENSMUST00000026288 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Il24-201ENSMUST00000121040 1159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Plut-201ENSMUST00000172461 855 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm20455-201ENSMUST00000174100 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm20821-202ENSMUST00000180352 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Ighv5-10-201ENSMUST00000194591 252 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 AC158122.1-201ENSMUST00000227398 673 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Dbil5-201ENSMUST00000040806 581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 AU015228-201ENSMUST00000121103 1320 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 P2rx7-201ENSMUST00000031425 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grin2bQ01097 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms