Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CartptP56388 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CartptP56388 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CartptP56388 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CartptP56388 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CartptP56388 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CartptP56388 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CartptP56388 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CartptP56388 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms