Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ggta1P23336 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ggta1P23336 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ggta1P23336 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ggta1P23336 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ggta1P23336 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ggta1P23336 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ggta1P23336 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ggta1P23336 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ggta1P23336 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ggta1P23336 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ggta1P23336 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms