Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Lima1-202ENSMUST00000109024 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Pkd1l3-201ENSMUST00000057344 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 AC156802.2-201ENSMUST00000225239 5740 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Rpl13aP19253 Nbr1-202ENSMUST00000103098 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Unc13d-202ENSMUST00000106450 4046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Zfyve16-201ENSMUST00000022217 6150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Kcna4-201ENSMUST00000037012 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Rimbp2-207ENSMUST00000200470 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Mycbp2-201ENSMUST00000159855 15233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Fto-203ENSMUST00000128081 4707 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Nebl-201ENSMUST00000028080 5780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Cntrl-202ENSMUST00000028237 7615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Ttll7-201ENSMUST00000037942 7394 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Jam2-202ENSMUST00000114195 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Flnb-201ENSMUST00000052678 9100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Mapkap1-203ENSMUST00000113126 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl13aP19253 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms