Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms