Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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Pop5Q9DB28 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Pop5Q9DB28 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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