Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q9CPS8 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CPS8 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CPS8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q9CPS8 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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