Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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Atg16l1Q8C0J2 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Atg16l1Q8C0J2 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Atg16l1Q8C0J2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Atg16l1Q8C0J2 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Atg16l1Q8C0J2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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