Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmeff1Q6PFE7 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms