Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Acad10-202ENSMUST00000111770 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Prdm1-204ENSMUST00000218369 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 A630012P03Rik-202ENSMUST00000114854 1974 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm12709-201ENSMUST00000149348 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx1P81068 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms