Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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