Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 HAUS6-202ENST00000380502 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms