Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ptk2P34152 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms