Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Smcr8-201ENSMUST00000056907 7391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Nod2-203ENSMUST00000118370 4653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Ccdc47-201ENSMUST00000002043 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Prpf40a-201ENSMUST00000076313 7374 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm10390-202ENSMUST00000181905 4269 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Synpo2-202ENSMUST00000106426 7063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Aqp4-201ENSMUST00000079081 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Adgrl2-213ENSMUST00000199059 4637 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Higd1aQ9JLR9 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms