Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 n-R5s5-201ENSMUST00000083134 119 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Trpc5-201ENSMUST00000040184 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Ighv2-2-201ENSMUST00000103443 352 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Hnf1aos1-202ENSMUST00000129609 516 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm42764-201ENSMUST00000197835 741 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 AC192333.3-201ENSMUST00000224041 463 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Olfr62-201ENSMUST00000102666 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm25426-201ENSMUST00000157606 170 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Fam162b-201ENSMUST00000020064 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 4930500F04Rik-203ENSMUST00000202177 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Rab38-202ENSMUST00000208478 579 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Tmem89-201ENSMUST00000026744 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm22982-201ENSMUST00000082613 319 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Ctse-201ENSMUST00000073350 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm31763-202ENSMUST00000218205 1724 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Ces1a-201ENSMUST00000095211 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm14344-201ENSMUST00000139338 580 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 A730090N16Rik-201ENSMUST00000160137 627 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm4398-201ENSMUST00000182698 992 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Tph1-202ENSMUST00000107669 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm26483-201ENSMUST00000158016 104 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm39348-201ENSMUST00000216861 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Pln-205ENSMUST00000219921 531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 AC113282.4-201ENSMUST00000225273 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 AU015228-201ENSMUST00000121103 1320 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm13413-201ENSMUST00000120953 602 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Olfr1155-201ENSMUST00000099843 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NischQ80TM9 2310016D03Rik-201ENSMUST00000190206 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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