Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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