Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssx9Q6XAS3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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