Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Nebl-201ENSMUST00000028080 5780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Skp2-202ENSMUST00000110585 6185 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Pcx-202ENSMUST00000113825 4044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Tmem170b-201ENSMUST00000129449 7168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gria1-202ENSMUST00000094179 5399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Sdc2-201ENSMUST00000022871 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Pogk-203ENSMUST00000131487 8692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Greb1-203ENSMUST00000159120 6346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Ccdc116-202ENSMUST00000115709 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Adgrl3-213ENSMUST00000120292 5026 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Zfp592-201ENSMUST00000107353 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Smyd3-204ENSMUST00000128302 6871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Krba1-208ENSMUST00000203371 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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