Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 DPY19L2P3-201ENST00000414296 2326 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 FMNL1-202ENST00000331495 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 TBC1D3F-201ENST00000620210 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ARL13B-201ENST00000303097 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ALOX5-208ENST00000612635 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 ZNF544-208ENST00000596825 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 KIF22-202ENST00000400751 2493 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 NOL10-205ENST00000538384 3418 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 DIRAS1-201ENST00000323469 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX1P83916 SPATA31C1-202ENST00000602681 1927 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBX1P83916 AL135960.1-201ENST00000422216 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBX1P83916 TSPEAR-204ENST00000614657 4027 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBX1P83916 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBX1P83916 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBX1P83916 C10orf90-201ENST00000284694 3076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CBX1P83916 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC134682.1-201ENST00000569285 3377 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC007608.4-201ENST00000623140 3365 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 LLGL2-205ENST00000577200 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 MPP4-204ENST00000409143 2082 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 PPARD-204ENST00000418635 3453 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 ERCC1-202ENST00000300853 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 HGNC:18790-209ENST00000513555 3291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 MED24-212ENST00000501516 3037 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SLC18A1-201ENST00000265808 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 ZBTB20-212ENST00000474710 2757 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SPCS1-206ENST00000619898 4254 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SLC45A4-202ENST00000517878 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 ARHGAP27-202ENST00000376922 3628 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CBX1P83916 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 PPP6C-202ENST00000415905 4172 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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