Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Otx1P80205 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Otx1P80205 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Otx1P80205 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Otx1P80205 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Otx1P80205 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Otx1P80205 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Otx1P80205 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Otx1P80205 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms