Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Lmo2P25801 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo2P25801 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms