Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms