Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Rps28-205ENSMUST00000173844 382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm34780-201ENSMUST00000193896 949 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm43833-201ENSMUST00000198828 293 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm11231-201ENSMUST00000117895 1706 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm25561-201ENSMUST00000104607 125 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm13413-201ENSMUST00000120953 602 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm10318-201ENSMUST00000186874 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm38132-201ENSMUST00000193358 707 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm5684-201ENSMUST00000198419 961 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Snrp1c-ps1-201ENSMUST00000205464 474 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 AC122459.4-201ENSMUST00000228654 551 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Ces1a-201ENSMUST00000095211 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm38309-201ENSMUST00000192063 1518 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Col5a3Q9JLI2 Oosp2-201ENSMUST00000121793 677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Col5a3Q9JLI2 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Col5a3Q9JLI2 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Col5a3Q9JLI2 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Tbce-201ENSMUST00000039894 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Fam216b-202ENSMUST00000118785 1447 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 P2rx7-201ENSMUST00000031425 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms