Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Snx20Q9D2Y5 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms