Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnna3Q65CL1 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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