Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Apoa1Q00623 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms