Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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